Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YIPF4Q9BSR8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms