Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP3BQ9BS92 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms