Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TM2D3Q9BRN9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D3Q9BRN9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms