Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MESP1Q9BRJ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MESP1Q9BRJ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms