Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms