Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC77Q9BR77 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms