Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM1Q9BR11 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms