Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHOXF2Q9BQY4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOXF2Q9BQY4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms