Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FYCO1Q9BQS8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms