Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS7

HEPH, Hephaestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEPHQ9BQS7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HEPHQ9BQS7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HEPHQ9BQS7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms