Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms