Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRQ99707 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRQ99707 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRQ99707 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRQ99707 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRQ99707 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRQ99707 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRQ99707 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRQ99707 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRQ99707 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRQ99707 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTRQ99707 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTRQ99707 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTRQ99707 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRQ99707 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRQ99707 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRQ99707 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRQ99707 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRQ99707 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRQ99707 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRQ99707 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRQ99707 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRQ99707 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRQ99707 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRQ99707 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRQ99707 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRQ99707 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRQ99707 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRQ99707 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRQ99707 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRQ99707 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRQ99707 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRQ99707 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRQ99707 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRQ99707 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRQ99707 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRQ99707 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRQ99707 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MTRQ99707 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRQ99707 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRQ99707 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRQ99707 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRQ99707 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms