Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYSTQ99698 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYSTQ99698 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms