Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PITX2Q99697 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms