Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC38A3Q99624 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A3Q99624 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms