Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD180Q99467 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD180Q99467 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD180Q99467 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD180Q99467 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD180Q99467 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD180Q99467 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD180Q99467 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD180Q99467 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD180Q99467 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD180Q99467 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD180Q99467 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD180Q99467 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD180Q99467 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD180Q99467 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD180Q99467 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD180Q99467 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD180Q99467 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD180Q99467 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD180Q99467 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD180Q99467 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD180Q99467 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD180Q99467 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD180Q99467 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD180Q99467 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD180Q99467 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD180Q99467 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD180Q99467 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms