Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYCBPQ99417 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYCBPQ99417 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms