Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UHRF1Q96T88 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UHRF1Q96T88 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UHRF1Q96T88 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms