Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
RSF1Q96T23 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RSF1Q96T23 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
RSF1Q96T23 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms