Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DCLRE1CQ96SD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCLRE1CQ96SD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCLRE1CQ96SD1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms