Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRNP1Q96S65 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP1Q96S65 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms