Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SORCS2Q96PQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms