Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms