Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCEEQ96PE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCEEQ96PE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms