Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGLYRP2Q96PD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGLYRP2Q96PD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms