Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RDH12Q96NR8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH12Q96NR8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms