Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD6Q96NK8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD6Q96NK8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD6Q96NK8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms