Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOPNLQ96NB1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOPNLQ96NB1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms