Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00615Q96LM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00615Q96LM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms