Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALPK3Q96L96 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK3Q96L96 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK3Q96L96 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms