Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INTS4Q96HW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
INTS4Q96HW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS4Q96HW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms