Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFRP2Q96HF1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFRP2Q96HF1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms