Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APIPQ96GX9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms