Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BICD1Q96G01 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms