Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT43Q96FT9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT43Q96FT9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT43Q96FT9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms