Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STAMBPL1Q96FJ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPL1Q96FJ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms