Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms