Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MFSD3Q96ES6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD3Q96ES6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms