Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L3HYPDHQ96EM0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L3HYPDHQ96EM0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms