Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MRPL53Q96EL3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms