Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PABPC5Q96DU9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC5Q96DU9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC5Q96DU9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms