Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPS1Q96D71 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
REPS1Q96D71 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REPS1Q96D71 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms