Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL29Q96CT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL29Q96CT2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms