Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIFAQ96CG3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIFAQ96CG3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms