Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ULK4Q96C45 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms