Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3DQ96BQ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM3DQ96BQ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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