Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC8Q96B26 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC8Q96B26 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms