Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RERGQ96A58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RERGQ96A58 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RERGQ96A58 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms