Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms