Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEIL2Q969S2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms